Een jongeman genaamd Thomas wordt wakker in een lift die hem naar een vreemde wereld voert die door de bewoners de Glade wordt genoemd en wordt bewoond door een groep jongens van zijn leeftijd. De Glade is een open ruimte, omgeven door de een gigantisch Doolhof (Maze) en de inwoners vermoeden dat het doolhof een uitgang heeft naar de buitenwereld. Om die reden worden elke avond twee lopers - maze runners - het doolhof ingestuurd. De taak lijkt hopeloos: het doolhof wordt bewaakt door Griefers, angstaanjagende wezens, half beest, half machine, die geen enkele genade kennen, en iedere dag worden de routes in het doolhof aangepast ...

 

The Maze Runner is niet zomaar de zoveelste film over een dystopische maatschappij, bevolkt door jonge mensen. De sfeer is veel dreigender dan in de meeste vergelijkbare producties zoals The Hunger Games, Divergent of Ender's Game. Veel scènes in The Maze Runner (en niet alleen die waarin de griefers een rol spelen) zijn pure horror. 

 

Is de Glade het enige veilige plekje op aarde? Of worden de jongeren opgevoerd in een show als Big Brother? Sommige bewoners willen liever blijven, niet ontsnappen, en voor hen vormt de ondernemende Thomas een bedreiging. Hun zorgen worden nog groter door de aankomst van de eerste vrouwelijke bewoner, Teresa, die Thomas lijkt te kennen en direct zijn zijde kliest. Thomas krijgt door de aankomst van Teresa plots hallucinaties over bizarre experimenten waaraan de jongeren voor hun aankomst in de Glade werden onderworpen ...